硅藻土表面帶有負電性，所以對于帶正電荷的膠體態(tài)污染物來說，它可實現(xiàn)電中和而使膠體脫穩(wěn)。但城市生活污水或綜合廢水中的膠體顆粒大多是帶負電的，所以如用普通的硅藻土作為污水處理劑，只能起到壓縮雙電層的作用，而無法使膠體顆粒脫穩(wěn)，處理效果不佳。所以對硅藻土進行各種方式的改性，使其對帶負電的膠體顆粒也能脫穩(wěn)。如采用鋁、鐵等帶正電荷的離子對其進行表面改性，或加入其他的絮凝劑復合制成改性硅藻土污水處理劑。
       對于復合其他絮凝劑制成的改性硅藻土處理劑而言，硅藻土一方面可作為形成絮體的骨架，改善礬花的結(jié)構(gòu)，即有助凝的作用，使形成的絮體密實而有較好的沉降性，從而改善了一般的化學絮凝劑產(chǎn)生的礬花松散、不易下沉的狀況；另一方面，由于其巨大的比表面積和表面吸附性等，脫穩(wěn)膠體易被吸附到硅藻土上，且附著了污染物質(zhì)的硅藻土顆粒間的相互吸附的能力也大，所以改性硅藻土用于污水處理時，能快速形成粒度和密度較大的絮體，且絮體的穩(wěn)定性好，甚至當絮體被打碎后，還可發(fā)生再絮凝，—這是其他鋁鹽、鐵鹽等常用污水絮凝劑所無法比擬的。 
       硅藻土的巨大比表面、強大吸附性以及表面電性，使得其在污水處理過程中，不但能去除顆粒態(tài)和膠體態(tài)的污染物質(zhì)，還能有效地去除色度和以溶解態(tài)存在的磷（導致富營養(yǎng)化的主要污染物之一）和金屬離子等。特別是對于含有較高工業(yè)廢水比例的城市污水，其可能有較大的色度和較高濃度的金屬離子，但對于改性硅藻土處理系統(tǒng)來說，由于其表面帶負電，能有效地吸附去除一部分帶正電荷的金屬離子。